Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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SAMD8Q96LT4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SAMD8Q96LT4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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SAMD8Q96LT4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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SAMD8Q96LT4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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SAMD8Q96LT4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMD8Q96LT4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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