Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
SIRT1Q96EB6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SIRT1Q96EB6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SIRT1Q96EB6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SIRT1Q96EB6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms