Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NXNL1Q96CM4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXNL1Q96CM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXNL1Q96CM4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms