Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TTC9Q92623 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTC9Q92623 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC9Q92623 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms