Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf54Q8N8G6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C15orf54Q8N8G6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms