Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC11Q7Z392 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC11Q7Z392 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms