Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNCKQ6P2M8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNCKQ6P2M8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms