Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF544Q6NX49 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF544Q6NX49 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms