Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAMD5Q5TGI4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SAMD5Q5TGI4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms