Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF19Q5SWL8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRAMEF19Q5SWL8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF19Q5SWL8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms