Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC93Q567U6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC93Q567U6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC93Q567U6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms