Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKN3Q16667 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN3Q16667 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN3Q16667 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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