Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A3Q16572 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A3Q16572 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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