Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNCBQ16143 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNCBQ16143 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNCBQ16143 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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