Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB35Q15286 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB35Q15286 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms