Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN4PQ13434 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MKRN4PQ13434 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN4PQ13434 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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