Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN3Q13064 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MKRN3Q13064 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN3Q13064 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
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