Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 PRO2YOR323C 1371 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 GND1YHR183W 1470 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 CHS5YLR330W 2016 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 MAL13YGR288W 1422 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 snR7-LsnR7-L 214 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YDR203WYDR203W 318 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YAP3YHL009C 993 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 IRC21YMR073C 606 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 LGE1YPL055C 999 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 snR44snR44 211 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 RTG2YGL252C 1767 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 HXT12YIL170W 1374 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 FAR10YLR238W 1437 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YDL050CYDL050C 372 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YDR056CYDR056C 618 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 SRB7YDR308C 423 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YGR219WYGR219W 342 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 SFH5YJL145W 885 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YKL083WYKL083W 615 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 EMG1YLR186W 759 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 TYE7YOR344C 876 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 PMT7YDR307W 1989 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 FRT1YOR324C 1809 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 ITR1YDR497C 1755 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 MRPS35YGR165W 1038 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 RPR2YIR015W 435 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 FYV7YLR068W 456 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 SDH5YOL071W 489 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YLR173WYLR173W 1827 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 SLM5YCR024C 1479 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 ERG13YML126C 1476 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 URK1YNR012W 1506 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 TYW3YGL050W 822 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YGR079WYGR079W 1113 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YKL071WYKL071W 771 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YLR279WYLR279W 390 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 ERG6YML008C 1152 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YPL077CYPL077C 723 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 FDH2YPL275W 711 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 KRE29YER038C 1395 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 TOP3YLR234W 1971 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 PRC1YMR297W 1599 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 SPS1YDR523C 1473 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MRPL1YDR116C 858 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 Q0092Q0092 141 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YGL242CYGL242C 546 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MMF1YIL051C 438 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YML084WYML084W 309 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 DIA4YHR011W 1341 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 AVT5YBL089W 1380 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 SPT14YPL175W 1359 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YCR022CYCR022C 345 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 TIM22YDL217C 624 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 RRP8YDR083W 1179 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YEL010WYEL010W 351 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 VPS25YJR102C 609 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 UTP5YDR398W 1932 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MSB4YOL112W 1479 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MAD3YJL013C 1548 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MHF2YDL160C-A 243 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 APT2YDR441C 546 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MST27YGL051W 705 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 GTF1YGR102C 552 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 BIG1YHR101C 1008 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MST28YAR033W 705 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 COX7YMR256C 183 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 ATG34YOL083W 1239 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 WRS1YOL097C 1299 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YOR289WYOR289W 756 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 ARR3YPR201W 1215 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 BUD30YDL151C 582 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 COQ4YDR204W 1008 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 GPI11YDR302W 660 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YGR012WYGR012W 1182 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 TWF1YGR080W 999 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 RNR2YJL026W 1200 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 VPS24YKL041W 675 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 COS3YML132W 1140 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 SAM37YMR060C 984 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 BUD17YNR027W 954 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YBR012CYBR012C 420 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 DGA1YOR245C 1257 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 EAF3YPR023C 1206 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MSI1YBR195C 1269 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 COS2YBR302C 1140 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 RPT2YDL007W 1314 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 AIM17YHL021C 1398 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 KIN28YDL108W 921 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 VPS74YDR372C 1038 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 KRE9YJL174W 831 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 GPM1YKL152C 744 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 YML083CYML083C 1257 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MRPL3YMR024W 1173 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 MDJ2YNL328C 441 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1A-BRQ12217 ABP1YCR088W 1779 nt7.22□□□□□ -1.25
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