Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3AQ05086 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3AQ05086 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms