Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUD4Q01804 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD4Q01804 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms