Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TFAMQ00059 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFAMQ00059 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1562.9 ms