Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX1P67809 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX1P67809 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX1P67809 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX1P67809 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX1P67809 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX1P67809 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX1P67809 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX1P67809 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBX1P67809 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
YBX1P67809 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX1P67809 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX1P67809 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX1P67809 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX1P67809 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX1P67809 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX1P67809 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX1P67809 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBX1P67809 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX1P67809 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX1P67809 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX1P67809 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX1P67809 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX1P67809 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX1P67809 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX1P67809 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX1P67809 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBX1P67809 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBX1P67809 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX1P67809 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX1P67809 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX1P67809 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX1P67809 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX1P67809 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX1P67809 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX1P67809 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX1P67809 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBX1P67809 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBX1P67809 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBX1P67809 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YBX1P67809 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX1P67809 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX1P67809 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX1P67809 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX1P67809 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX1P67809 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX1P67809 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBX1P67809 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX1P67809 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX1P67809 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX1P67809 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX1P67809 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX1P67809 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX1P67809 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBX1P67809 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX1P67809 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX1P67809 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX1P67809 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX1P67809 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX1P67809 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YBX1P67809 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX1P67809 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX1P67809 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX1P67809 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX1P67809 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX1P67809 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX1P67809 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX1P67809 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YBX1P67809 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms