Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL23P62829 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL23P62829 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL23P62829 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL23P62829 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL23P62829 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL23P62829 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL23P62829 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL23P62829 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL23P62829 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL23P62829 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL23P62829 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL23P62829 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL23P62829 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL23P62829 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL23P62829 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL23P62829 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL23P62829 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL23P62829 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL23P62829 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL23P62829 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL23P62829 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL23P62829 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL23P62829 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL23P62829 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL23P62829 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPL23P62829 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPL23P62829 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL23P62829 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL23P62829 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL23P62829 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL23P62829 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL23P62829 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL23P62829 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL23P62829 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL23P62829 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL23P62829 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL23P62829 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL23P62829 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL23P62829 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL23P62829 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL23P62829 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL23P62829 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL23P62829 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL23P62829 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL23P62829 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL23P62829 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms