Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC00205P59089 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC00205P59089 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms