Protein–RNA interactions for Protein: P25579

LRE1, Laminarase-resistance protein LRE1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LRE1P25579 VMA13YPR036W 1437 nt5.36□□□□□ -1.55
LRE1P25579 EPS1YIL005W 2106 nt5.36□□□□□ -1.55
LRE1P25579 HAP1YLR256W 4509 nt5.35□□□□□ -1.55
LRE1P25579 RPN12YFR052W 825 nt5.35□□□□□ -1.55
LRE1P25579 YNL108CYNL108C 813 nt5.35□□□□□ -1.55
LRE1P25579 BRF1YGR246C 1791 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 DBP9YLR276C 1785 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 ATR1YML116W 1629 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 TRP3YKL211C 1455 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 CLP1YOR250C 1338 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 DNF2YDR093W 4839 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 ASP1YDR321W 1146 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 YIL086CYIL086C 309 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 ARG8YOL140W 1272 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 RPL21BYPL079W 483 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 YPL113CYPL113C 1191 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 YOR1YGR281W 4434 nt5.34□□□□□ -1.55
LRE1P25579 VHT1YGR065C 1782 nt5.34□□□□□ -1.56
LRE1P25579 NAG1YGR031C-A 492 nt5.33□□□□□ -1.56
LRE1P25579 COX17YLL009C 210 nt5.33□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YOR024WYOR024W 324 nt5.33□□□□□ -1.56
LRE1P25579 FAA4YMR246W 2085 nt5.33□□□□□ -1.56
LRE1P25579 FOL1YNL256W 2475 nt5.32□□□□□ -1.56
LRE1P25579 PRE7YBL041W 726 nt5.32□□□□□ -1.56
LRE1P25579 SEC17YBL050W 879 nt5.32□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YOR292CYOR292C 930 nt5.32□□□□□ -1.56
LRE1P25579 SET4YJL105W 1683 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 RPT4YOR259C 1314 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 MNN10YDR245W 1182 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 RMD5YDR255C 1266 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 ERV14YGL054C 417 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 SEH1YGL100W 1050 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YGL262WYGL262W 528 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 ARP1YHR129C 1155 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 GTR1YML121W 933 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YOL024WYOL024W 519 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 MRL1YPR079W 1146 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 GUP2YPL189W 1830 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 STE12YHR084W 2067 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 VPS70YJR126C 2436 nt5.31□□□□□ -1.56
LRE1P25579 RFA1YAR007C 1866 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 GLT1YDL171C 6438 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 RIM15YFL033C 5313 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 RRP45YDR280W 918 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YER134CYER134C 537 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 NVJ1YHR195W 966 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YNL019CYNL019C 855 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YNL033WYNL033W 855 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 CKS1YBR135W 453 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 FHL1YPR104C 2811 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 TNA1YGR260W 1605 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 SSZ1YHR064C 1617 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 PRT1YOR361C 2292 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 MSH1YHR120W 2880 nt5.3□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YEL077CYEL077C 3834 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 snR78snR78 87 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 VCX1YDL128W 1236 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 ERG26YGL001C 1050 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 NQM1YGR043C 1002 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YLF2YHL014C 1218 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YKR041WYKR041W 753 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 MID2YLR332W 1131 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YNL143CYNL143C 393 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 ECM3YOR092W 1842 nt5.29□□□□□ -1.56
LRE1P25579 FKH1YIL131C 1455 nt5.28□□□□□ -1.56
LRE1P25579 GSH2YOL049W 1476 nt5.28□□□□□ -1.56
LRE1P25579 ERD1YDR414C 1089 nt5.28□□□□□ -1.56
LRE1P25579 BGL2YGR282C 942 nt5.28□□□□□ -1.56
LRE1P25579 MPM1YJL066C 759 nt5.28□□□□□ -1.56
LRE1P25579 YNR042WYNR042W 429 nt5.28□□□□□ -1.56
LRE1P25579 SFB3YHR098C 2790 nt5.28□□□□□ -1.56
LRE1P25579 TUB2YFL037W 1374 nt5.28□□□□□ -1.56
LRE1P25579 THP1YOL072W 1368 nt5.28□□□□□ -1.56
LRE1P25579 SAC6YDR129C 1929 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 YDL241WYDL241W 372 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 OMS1YDR316W 1416 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 PFA5YDR459C 1125 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 SKN1YGR143W 2316 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 NIT2YJL126W 924 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 RPB4YJL140W 666 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 TIF34YMR146C 1044 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 CKB2YOR039W 777 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 ALT2YDR111C 1524 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 HPF1YOL155C 2904 nt5.27□□□□□ -1.57
LRE1P25579 YGL101WYGL101W 648 nt5.26□□□□□ -1.57
LRE1P25579 OMA1YKR087C 1038 nt5.26□□□□□ -1.57
LRE1P25579 YMR010WYMR010W 1218 nt5.26□□□□□ -1.57
LRE1P25579 YNL296WYNL296W 315 nt5.26□□□□□ -1.57
LRE1P25579 JEM1YJL073W 1938 nt5.25□□□□□ -1.57
LRE1P25579 MAL13YGR288W 1422 nt5.25□□□□□ -1.57
LRE1P25579 YIL067CYIL067C 2037 nt5.25□□□□□ -1.57
LRE1P25579 ARO9YHR137W 1542 nt5.25□□□□□ -1.57
LRE1P25579 ADE4YMR300C 1533 nt5.25□□□□□ -1.57
LRE1P25579 IWR1YDL115C 1062 nt5.25□□□□□ -1.57
LRE1P25579 ATP12YJL180C 978 nt5.25□□□□□ -1.57
LRE1P25579 UIP3YAR027W 708 nt5.25□□□□□ -1.57
LRE1P25579 NMD4YLR363C 657 nt5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.2 ms