Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP1P23763 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VAMP1P23763 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms