Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX1P22670 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFX1P22670 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFX1P22670 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX1P22670 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX1P22670 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX1P22670 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX1P22670 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFX1P22670 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFX1P22670 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFX1P22670 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX1P22670 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX1P22670 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX1P22670 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX1P22670 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX1P22670 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX1P22670 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX1P22670 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX1P22670 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFX1P22670 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX1P22670 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX1P22670 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX1P22670 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX1P22670 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX1P22670 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX1P22670 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX1P22670 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFX1P22670 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFX1P22670 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX1P22670 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX1P22670 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX1P22670 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFX1P22670 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX1P22670 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX1P22670 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX1P22670 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX1P22670 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX1P22670 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX1P22670 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX1P22670 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFX1P22670 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX1P22670 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX1P22670 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX1P22670 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX1P22670 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX1P22670 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX1P22670 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX1P22670 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX1P22670 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.6 ms