Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1P21675 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1P21675 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1P21675 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1P21675 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1P21675 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1P21675 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1P21675 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1P21675 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1P21675 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1P21675 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1P21675 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1P21675 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1P21675 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1P21675 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1P21675 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1P21675 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1P21675 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1P21675 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1P21675 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF1P21675 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF1P21675 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF1P21675 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1P21675 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1P21675 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1P21675 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1P21675 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1P21675 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1P21675 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1P21675 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1P21675 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1P21675 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1P21675 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1P21675 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1P21675 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1P21675 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1P21675 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1P21675 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1P21675 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1P21675 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1P21675 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF1P21675 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF1P21675 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF1P21675 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TAF1P21675 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1P21675 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1P21675 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1P21675 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1P21675 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1P21675 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TAF1P21675 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1P21675 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1P21675 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1P21675 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1P21675 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1P21675 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1P21675 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1P21675 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TAF1P21675 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF1P21675 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF1P21675 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF1P21675 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF1P21675 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TAF1P21675 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TAF1P21675 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1P21675 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1P21675 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TAF1P21675 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms