Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCB4P21439 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ABCB4P21439 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ABCB4P21439 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms