Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DMDP11532 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DMDP11532 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DMDP11532 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DMDP11532 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DMDP11532 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DMDP11532 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DMDP11532 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DMDP11532 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMDP11532 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMDP11532 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMDP11532 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DMDP11532 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMDP11532 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DMDP11532 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMDP11532 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMDP11532 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DMDP11532 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DMDP11532 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DMDP11532 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DMDP11532 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DMDP11532 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DMDP11532 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DMDP11532 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DMDP11532 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DMDP11532 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DMDP11532 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMDP11532 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMDP11532 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMDP11532 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DMDP11532 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DMDP11532 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DMDP11532 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DMDP11532 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DMDP11532 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DMDP11532 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DMDP11532 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DMDP11532 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DMDP11532 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DMDP11532 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DMDP11532 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DMDP11532 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DMDP11532 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DMDP11532 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DMDP11532 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DMDP11532 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms