Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IGKV1-13P0DP09 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IGKV1-13P0DP09 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms