Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
PNMA6AP0CW24 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA6AP0CW24 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms