Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APODP05090 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APODP05090 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APODP05090 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APODP05090 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APODP05090 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APODP05090 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APODP05090 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APODP05090 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APODP05090 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APODP05090 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APODP05090 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APODP05090 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APODP05090 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APODP05090 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APODP05090 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APODP05090 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APODP05090 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APODP05090 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APODP05090 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APODP05090 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APODP05090 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APODP05090 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APODP05090 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APODP05090 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APODP05090 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APODP05090 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APODP05090 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APODP05090 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APODP05090 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APODP05090 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APODP05090 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
APODP05090 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APODP05090 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APODP05090 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APODP05090 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APODP05090 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APODP05090 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APODP05090 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APODP05090 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APODP05090 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APODP05090 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APODP05090 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APODP05090 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APODP05090 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APODP05090 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APODP05090 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APODP05090 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APODP05090 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APODP05090 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APODP05090 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APODP05090 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APODP05090 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APODP05090 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APODP05090 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APODP05090 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APODP05090 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APODP05090 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APODP05090 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APODP05090 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APODP05090 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APODP05090 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms