Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB4AP04350 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms