Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESR1P03372 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESR1P03372 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESR1P03372 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESR1P03372 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESR1P03372 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESR1P03372 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ESR1P03372 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESR1P03372 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESR1P03372 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESR1P03372 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESR1P03372 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESR1P03372 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ESR1P03372 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESR1P03372 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESR1P03372 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESR1P03372 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESR1P03372 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ESR1P03372 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ESR1P03372 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ESR1P03372 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESR1P03372 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESR1P03372 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESR1P03372 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESR1P03372 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESR1P03372 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ESR1P03372 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESR1P03372 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESR1P03372 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESR1P03372 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESR1P03372 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ESR1P03372 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESR1P03372 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESR1P03372 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESR1P03372 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESR1P03372 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESR1P03372 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESR1P03372 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESR1P03372 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESR1P03372 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ESR1P03372 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESR1P03372 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESR1P03372 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESR1P03372 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESR1P03372 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESR1P03372 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ESR1P03372 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ESR1P03372 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESR1P03372 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESR1P03372 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESR1P03372 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESR1P03372 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ESR1P03372 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESR1P03372 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESR1P03372 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ESR1P03372 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ESR1P03372 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ESR1P03372 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ESR1P03372 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESR1P03372 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESR1P03372 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESR1P03372 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ESR1P03372 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESR1P03372 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESR1P03372 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESR1P03372 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESR1P03372 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESR1P03372 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ESR1P03372 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESR1P03372 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ESR1P03372 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESR1P03372 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESR1P03372 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ESR1P03372 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESR1P03372 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESR1P03372 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESR1P03372 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESR1P03372 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ESR1P03372 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms