Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	SSP120	YLR250W	705 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	CTR3	YLR411W	726 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	YML119W	YML119W	1074 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	KTR3	YBR205W	1215 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	GSM1	YJL103C	1857 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	NNK1	YKL171W	2787 nt		3.96	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	RCK1	YGL158W	1539 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	ATG1	YGL180W	2694 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	YPL260W	YPL260W	1656 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	ERD1	YDR414C	1089 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	YJR115W	YJR115W	510 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	ISU2	YOR226C	471 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	SBE2	YDR351W	2595 nt		3.95	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	CTS1	YLR286C	1689 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	MMT2	YPL224C	1455 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	AVT1	YJR001W	1809 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	IPK1	YDR315C	846 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	UTR4	YEL038W	684 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	ACT1	YFL039C	1128 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	TEF4	YKL081W	1239 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	snR17b	snR17b	332 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	DCC1	YCL016C	1143 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	PUS1	YPL212C	1635 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	FAP1	YNL023C	2898 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	CDC19	YAL038W	1503 nt		3.94	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	ATG20	YDL113C	1923 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	GIP1	YBR045C	1920 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	IZH3	YLR023C	1632 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	MHF2	YDL160C-A	243 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	PRP45	YAL032C	1140 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	JJJ3	YJR097W	519 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	CBP3	YPL215W	1008 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	MRL1	YPR079W	1146 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	APE1	YKL103C	1545 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	CUE2	YKL090W	1332 nt		3.93	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	GRC3	YLL035W	1899 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	KRE6	YPR159W	2163 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	LYS5	YGL154C	819 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	YPT32	YGL210W	669 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	RMR1	YGL250W	726 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	GTO1	YGR154C	1071 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	HPM1	YIL110W	1134 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	PGM2	YMR105C	1710 nt		3.92	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	PHO8	YDR481C	1701 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	CBF1	YJR060W	1056 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	SNN1	YNL086W	309 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	MDM12	YOL009C	816 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	NPT1	YOR209C	1290 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	SMA1	YPL027W	738 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	RPL21B	YPL079W	483 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	PHO84	YML123C	1764 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	ICE2	YIL090W	1476 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	MTF2	YDL044C	1323 nt		3.91	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	CAB3	YKL088W	1716 nt		3.9	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	COQ6	YGR255C	1440 nt		3.9	□□□□□ -1.78
VAR1	P02381	MDM30	YLR368W	1797 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	KIN28	YDL108W	921 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	BCP1	YDR361C	852 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	IPI1	YHR085W	1005 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	COG5	YNL051W	1212 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	RER2	YBR002C	861 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	ECM7	YLR443W	1347 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	STB2	YMR053C	2553 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	AVT3	YKL146W	2079 nt		3.9	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	HUL4	YJR036C	2679 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	TDH3	YGR192C	999 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	CPR6	YLR216C	1116 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	PDX3	YBR035C	687 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	KCC4	YCL024W	3114 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	GAL10	YBR019C	2100 nt		3.89	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YGL036W	YGL036W	2730 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	PFK1	YGR240C	2964 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	MNT2	YGL257C	1677 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	ADY2	YCR010C	852 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	NAG1	YGR031C-A	492 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	SYF2	YGR129W	648 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YHR127W	YHR127W	732 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YMR085W	YMR085W	1299 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YCL022C	YCL022C	516 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	ALD3	YMR169C	1521 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	ALD2	YMR170C	1521 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	ATR1	YML116W	1629 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	HXT14	YNL318C	1623 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	LYS2	YBR115C	4179 nt		3.88	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	RKM2	YDR198C	1440 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	VBA2	YBR293W	1425 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	YAP1	YML007W	1953 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	PCL8	YPL219W	1479 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	CRT10	YOL063C	2874 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	ERP5	YHR110W	639 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	EFM4	YIL064W	774 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	MNN11	YJL183W	1269 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	MTC2	YKL098W	1074 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	SCW10	YMR305C	1170 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	NME1	NME1	340 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	RSC30	YHR056C	2652 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	TIM54	YJL054W	1437 nt		3.87	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	HOM3	YER052C	1584 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	PRR1	YKL116C	1557 nt		3.86	□□□□□ -1.79
VAR1	P02381	RSM10	YDR041W	612 nt		3.86	□□□□□ -1.79

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