Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX3O95343 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX3O95343 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX3O95343 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX3O95343 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX3O95343 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX3O95343 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX3O95343 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX3O95343 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX3O95343 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX3O95343 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX3O95343 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIX3O95343 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX3O95343 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX3O95343 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX3O95343 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX3O95343 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIX3O95343 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIX3O95343 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIX3O95343 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIX3O95343 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms