Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN7O94888 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN7O94888 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms