Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEDO75530 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEDO75530 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEDO75530 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EEDO75530 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EEDO75530 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EEDO75530 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEDO75530 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEDO75530 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEDO75530 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEDO75530 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EEDO75530 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEDO75530 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EEDO75530 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EEDO75530 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EEDO75530 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EEDO75530 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EEDO75530 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EEDO75530 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EEDO75530 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EEDO75530 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EEDO75530 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEDO75530 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEDO75530 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEDO75530 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEDO75530 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEDO75530 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEDO75530 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEDO75530 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EEDO75530 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEDO75530 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEDO75530 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEDO75530 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEDO75530 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEDO75530 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEDO75530 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEDO75530 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EEDO75530 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EEDO75530 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEDO75530 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEDO75530 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEDO75530 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEDO75530 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEDO75530 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEDO75530 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.2 ms