Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX3O60493 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX3O60493 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX3O60493 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX3O60493 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX3O60493 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX3O60493 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX3O60493 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX3O60493 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX3O60493 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX3O60493 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX3O60493 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX3O60493 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX3O60493 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX3O60493 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX3O60493 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX3O60493 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX3O60493 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX3O60493 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX3O60493 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX3O60493 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX3O60493 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX3O60493 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX3O60493 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX3O60493 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX3O60493 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX3O60493 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX3O60493 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX3O60493 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX3O60493 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX3O60493 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX3O60493 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX3O60493 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX3O60493 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX3O60493 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX3O60493 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX3O60493 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX3O60493 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX3O60493 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX3O60493 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX3O60493 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX3O60493 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX3O60493 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX3O60493 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX3O60493 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX3O60493 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX3O60493 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX3O60493 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX3O60493 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX3O60493 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX3O60493 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX3O60493 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX3O60493 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX3O60493 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX3O60493 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX3O60493 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX3O60493 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX3O60493 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX3O60493 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX3O60493 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX3O60493 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX3O60493 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX3O60493 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX3O60493 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX3O60493 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX3O60493 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX3O60493 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX3O60493 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX3O60493 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX3O60493 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX3O60493 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms