Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMAD6O43541 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms