Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EIF3CLB5ME19 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF3CLB5ME19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3CLB5ME19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms