Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRIQ3A6PVS8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRIQ3A6PVS8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRIQ3A6PVS8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms