Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PRR13-206ENST00000549135 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.864e-9■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.034e-9■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HSP90B1-202ENST00000540297 590 ntTSL 323.71■■□□□ 1.392e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.032e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 420.96■□□□□ 0.952e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.192e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.52e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 TRIM28-214ENST00000600840 338 ntTSL 210.45□□□□□ -0.747e-8■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.374e-16■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.124e-16■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.394e-16■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.64e-16■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.714e-16■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CDK2AP2-204ENST00000531178 923 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.423e-25■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CDC37-210ENST00000593124 1389 ntTSL 523.13■■□□□ 1.293e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.261e-28■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 13e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.913e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 DOLPP1-201ENST00000327812 1932 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.883e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 CDC37-203ENST00000588869 966 ntTSL 520.34■□□□□ 0.853e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 EVL-213ENST00000554695 1119 ntTSL 519.16■□□□□ 0.663e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.593e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 EVL-217ENST00000555848 1547 ntTSL 1 (best)17.57■□□□□ 0.43e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 GTF2F1-202ENST00000593678 1705 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 EVL-215ENST00000555606 656 ntTSL 316.68■□□□□ 0.263e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 FHOD1-207ENST00000567752 4321 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-28■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 FHOD1-209ENST00000569085 735 ntTSL 216.23■□□□□ 0.191e-28■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 MRPL48-214ENST00000544819 742 ntTSL 215.92■□□□□ 0.142e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 MRPL48-209ENST00000540162 1004 ntTSL 514.31□□□□□ -0.122e-19■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 EVL-210ENST00000554045 1754 ntTSL 514.3□□□□□ -0.123e-10■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.21e-28■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 GSPT1-208ENST00000565267 1864 ntTSL 510.34□□□□□ -0.751e-28■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 GSPT1-206ENST00000563468 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.841e-28■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.041e-323■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPL-203ENST00000595164 2404 ntTSL 214.3□□□□□ -0.121e-323■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPL-204ENST00000595443 2122 ntTSL 212.76□□□□□ -0.371e-323■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPL-206ENST00000597731 3094 ntTSL 211.61□□□□□ -0.551e-323■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPL-205ENST00000595804 588 ntTSL 210.3□□□□□ -0.761e-323■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 59.69□□□□□ -0.861e-323■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 524.63■■□□□ 1.535e-32■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.245e-32■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.935e-32■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.835e-32■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)20.1■□□□□ 0.815e-32■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.335e-32■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.045e-32■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.465e-32■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.795e-32■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 SNRPD1-203ENST00000579618 320 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.437e-23■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 512.97□□□□□ -0.334e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.554e-7■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.662e-60■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 HINT1-203ENST00000506207 369 ntTSL 56.9□□□□□ -1.37e-12■□□□□ 8.3
PABPC4Q13310 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 327.15■■□□□ 1.943e-6■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 516.81■□□□□ 0.283e-6■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.27e-27■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.797e-27■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.527e-27■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 H2AFV-203ENST00000349299 596 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.597e-27■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.247e-27■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 PPP4C-203ENST00000562222 742 ntTSL 328.69■■■□□ 2.181e-9■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 PPP4C-207ENST00000563732 846 ntTSL 224.5■■□□□ 1.511e-9■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 525.38■■□□□ 1.651e-14■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FTSJ1-211ENST00000490202 965 ntTSL 523.29■■□□□ 1.328e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ACADM-211ENST00000528016 546 ntTSL 422.52■■□□□ 1.23e-11■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.898e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.678e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 POLA2-208ENST00000534785 741 ntTSL 319.12■□□□□ 0.658e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.598e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 POLA2-203ENST00000527618 1924 ntTSL 217.63■□□□□ 0.418e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FTSJ1-213ENST00000496365 1287 ntTSL 516.65■□□□□ 0.268e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.168e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.063e-11■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FTSJ1-210ENST00000489599 778 ntTSL 315.14■□□□□ 0.018e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -03e-11■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-11■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.268e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DDX19A-209ENST00000566574 5007 ntTSL 1 (best)13.11□□□□□ -0.318e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.418e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 POLA2-202ENST00000525924 873 ntTSL 511.55□□□□□ -0.568e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DDX19A-214ENST00000569771 3067 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.598e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DDX19A-204ENST00000562140 3121 ntTSL 511.33□□□□□ -0.68e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ZNF195-207ENST00000429541 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.618e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ZNF195-204ENST00000354599 2970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.618e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ZNF195-205ENST00000399602 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.618e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FTSJ1-205ENST00000467954 803 ntTSL 311.21□□□□□ -0.618e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ZNF195-220ENST00000528796 881 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.638e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.838e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ZNF195-230ENST00000620374 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.878e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FTSJ1-204ENST00000466371 736 ntTSL 29.4□□□□□ -0.98e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.048e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.088e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 SQLE-203ENST00000518931 554 ntTSL 47.71□□□□□ -1.188e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FTSJ1-207ENST00000475806 576 ntTSL 36.95□□□□□ -1.38e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.318e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 SQLE-202ENST00000518604 743 ntTSL 26.5□□□□□ -1.378e-8■□□□□ 8.2
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