RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562222.5

PPP4C-203, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-203ENST00000562222 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.42■■■■■ 6.94
PPP4C-203ENST00000562222 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.08■■■■■ 5.93
PPP4C-203ENST00000562222 ABCC9O60706 1549 aa51.84■■■■■ 5.89
PPP4C-203ENST00000562222 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.45■■■■■ 5.51
PPP4C-203ENST00000562222 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.34■■■■■ 5.49
PPP4C-203ENST00000562222 NACADO15069 1562 aa49.24■■■■■ 5.47
PPP4C-203ENST00000562222 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.7■■■■■ 5.39
PPP4C-203ENST00000562222 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
PPP4C-203ENST00000562222 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.45■■■■■ 5.35
PPP4C-203ENST00000562222 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.33■■■■■ 5.33
PPP4C-203ENST00000562222 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.24■■■■■ 5.31
PPP4C-203ENST00000562222 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.21■■■■■ 5.31
PPP4C-203ENST00000562222 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.98■■■■■ 5.27
PPP4C-203ENST00000562222 SCRIBQ14160 1630 aa47.58■■■■■ 5.21
PPP4C-203ENST00000562222 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.37■■■■■ 5.17
PPP4C-203ENST00000562222 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
PPP4C-203ENST00000562222 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.78■■■■■ 5.08
PPP4C-203ENST00000562222 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.64■■■■■ 5.06
PPP4C-203ENST00000562222 NCAPD3P42695 1498 aa45.51■■■■■ 4.88
PPP4C-203ENST00000562222 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.43■■■■■ 4.86
PPP4C-203ENST00000562222 SMARCA4P51532 1647 aa45.41■■■■■ 4.86
PPP4C-203ENST00000562222 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
PPP4C-203ENST00000562222 SMARCA2P51531 1590 aa45.28■■■■■ 4.84
PPP4C-203ENST00000562222 HMGXB3Q12766 1538 aa45.12■■■■■ 4.81
PPP4C-203ENST00000562222 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.03■■■■■ 4.8
PPP4C-203ENST00000562222 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
PPP4C-203ENST00000562222 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.96■■■■■ 4.79
PPP4C-203ENST00000562222 ERCC6Q03468 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
PPP4C-203ENST00000562222 NESP48681 1621 aa44.64■■■■■ 4.74
PPP4C-203ENST00000562222 WIZO95785 1651 aa44.45■■■■■ 4.71
PPP4C-203ENST00000562222 CUX2O14529 1486 aa44.44■■■■■ 4.7
PPP4C-203ENST00000562222 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.34■■■■■ 4.69
PPP4C-203ENST00000562222 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
PPP4C-203ENST00000562222 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.19■■■■■ 4.67
PPP4C-203ENST00000562222 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.17■■■■■ 4.66
PPP4C-203ENST00000562222 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.05■■■■■ 4.64
PPP4C-203ENST00000562222 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
PPP4C-203ENST00000562222 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.95■■■■■ 4.63
PPP4C-203ENST00000562222 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
PPP4C-203ENST00000562222 CFTRP13569 1480 aa43.73■■■■■ 4.59
PPP4C-203ENST00000562222 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.7■■■■■ 4.59
PPP4C-203ENST00000562222 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.64■■■■■ 4.58
PPP4C-203ENST00000562222 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.63■■■■■ 4.57
PPP4C-203ENST00000562222 WDR62O43379 1518 aa43.53■■■■■ 4.56
PPP4C-203ENST00000562222 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.51■■■■■ 4.56
PPP4C-203ENST00000562222 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
PPP4C-203ENST00000562222 PRDM2Q13029 1718 aa43.11■■■■■ 4.49
PPP4C-203ENST00000562222 TOPBP1Q92547 1522 aa42.84■■■■■ 4.45
PPP4C-203ENST00000562222 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
PPP4C-203ENST00000562222 ABCC8Q09428 1581 aa42.81■■■■■ 4.44
PPP4C-203ENST00000562222 IFT140Q96RY7 1462 aa42.76■■■■■ 4.44
PPP4C-203ENST00000562222 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.69■■■■■ 4.42
PPP4C-203ENST00000562222 OSCARQ8IYS5 282 aa42.65■■■■■ 4.42
PPP4C-203ENST00000562222 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
PPP4C-203ENST00000562222 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
PPP4C-203ENST00000562222 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.37■■■■■ 4.376e-7■■■■□ 24.5
PPP4C-203ENST00000562222 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
PPP4C-203ENST00000562222 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
PPP4C-203ENST00000562222 SOGA1O94964 1423 aa42.33■■■■■ 4.37
PPP4C-203ENST00000562222 TRIM41Q8WV44 630 aa42.33■■■■■ 4.37
PPP4C-203ENST00000562222 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.32■■■■■ 4.37
PPP4C-203ENST00000562222 CUX1P39880 1505 aa42.26■■■■■ 4.36
PPP4C-203ENST00000562222 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.24■■■■■ 4.35
PPP4C-203ENST00000562222 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
PPP4C-203ENST00000562222 FBLN2P98095 1184 aa42.09■■■■■ 4.33
PPP4C-203ENST00000562222 WDR97A6NE52 1622 aa41.95■■■■■ 4.31
PPP4C-203ENST00000562222 CHD1O14646 1710 aa41.9■■■■■ 4.3
PPP4C-203ENST00000562222 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.89■■■■■ 4.3
PPP4C-203ENST00000562222 GRIN2BQ13224 1484 aa41.86■■■■■ 4.29
PPP4C-203ENST00000562222 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
PPP4C-203ENST00000562222 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
PPP4C-203ENST00000562222 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
PPP4C-203ENST00000562222 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
PPP4C-203ENST00000562222 ARHGEF11O15085 1522 aa41.8■■■■■ 4.28
PPP4C-203ENST00000562222 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.79■■■■■ 4.28
PPP4C-203ENST00000562222 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.79■■■■■ 4.28
PPP4C-203ENST00000562222 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
PPP4C-203ENST00000562222 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.78■■■■■ 4.28
PPP4C-203ENST00000562222 TOP2BQ02880 1626 aa41.67■■■■■ 4.26
PPP4C-203ENST00000562222 SYNJ2O15056 1496 aa41.66■■■■■ 4.26
PPP4C-203ENST00000562222 SYNJ1O43426 1573 aa41.63■■■■■ 4.26
PPP4C-203ENST00000562222 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.63■■■■■ 4.25
PPP4C-203ENST00000562222 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.62■■■■■ 4.25
PPP4C-203ENST00000562222 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.6■■■■■ 4.25
PPP4C-203ENST00000562222 PBRM1Q86U86 1689 aa41.58■■■■■ 4.25
PPP4C-203ENST00000562222 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.49■■■■■ 4.23
PPP4C-203ENST00000562222 ARAP1Q96P48 1450 aa41.43■■■■■ 4.22
PPP4C-203ENST00000562222 GRIN2AQ12879 1464 aa41.3■■■■■ 4.2
PPP4C-203ENST00000562222 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.28■■■■■ 4.2
PPP4C-203ENST00000562222 ADAMTS12P58397 1594 aa41.26■■■■■ 4.2
PPP4C-203ENST00000562222 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.24■■■■■ 4.19
PPP4C-203ENST00000562222 NUP160Q12769 1436 aa41.15■■■■■ 4.18
PPP4C-203ENST00000562222 CEP170Q5SW79 1584 aa41.08■■■■■ 4.17
PPP4C-203ENST00000562222 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
PPP4C-203ENST00000562222 KIF27Q86VH2 1401 aa40.98■■■■■ 4.15
PPP4C-203ENST00000562222 IGF1RP08069 1367 aa40.95■■■■■ 4.15
PPP4C-203ENST00000562222 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.91■■■■■ 4.14
PPP4C-203ENST00000562222 JPH4Q96JJ6 628 aa40.87■■■■■ 4.13
PPP4C-203ENST00000562222 SHROOM2Q13796 1616 aa40.83■■■■■ 4.13
PPP4C-203ENST00000562222 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms