RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534785.1

POLA2-208, Transcript of DNA polymerase alpha 2, accessory subunit, human

TSL 3

Gene POLA2, Length 741 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLA2-208	ENST00000534785	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.78	■■■■□ 3.8
POLA2-208	ENST00000534785	ABCC9	O60706	1549 aa		34.91	■■■■□ 3.18
POLA2-208	ENST00000534785	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.84	■■■■□ 3.17
POLA2-208	ENST00000534785	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.19	■■■□□ 2.9
POLA2-208	ENST00000534785	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.01	■■■□□ 2.87
POLA2-208	ENST00000534785	NACAD	O15069	1562 aa		32.89	■■■□□ 2.86
POLA2-208	ENST00000534785	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.49	■■■□□ 2.79
POLA2-208	ENST00000534785	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.49	■■■□□ 2.79
POLA2-208	ENST00000534785	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.44	■■■□□ 2.78
POLA2-208	ENST00000534785	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.29	■■■□□ 2.76
POLA2-208	ENST00000534785	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
POLA2-208	ENST00000534785	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.09	■■■□□ 2.73
POLA2-208	ENST00000534785	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		31.93	■■■□□ 2.7
POLA2-208	ENST00000534785	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.9	■■■□□ 2.7
POLA2-208	ENST00000534785	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.64	■■■□□ 2.66
POLA2-208	ENST00000534785	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.48	■■■□□ 2.63
POLA2-208	ENST00000534785	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
POLA2-208	ENST00000534785	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.39	■■■□□ 2.62
POLA2-208	ENST00000534785	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.32	■■■□□ 2.44
POLA2-208	ENST00000534785	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.27	■■■□□ 2.44
POLA2-208	ENST00000534785	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.26	■■■□□ 2.44
POLA2-208	ENST00000534785	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.24	■■■□□ 2.43
POLA2-208	ENST00000534785	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.22	■■■□□ 2.43
POLA2-208	ENST00000534785	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.16	■■■□□ 2.42
POLA2-208	ENST00000534785	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.14	■■■□□ 2.42
POLA2-208	ENST00000534785	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.1	■■■□□ 2.41
POLA2-208	ENST00000534785	CUX2	O14529	1486 aa		29.96	■■■□□ 2.39
POLA2-208	ENST00000534785	NES	P48681	1621 aa		29.94	■■■□□ 2.38
POLA2-208	ENST00000534785	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.91	■■■□□ 2.38
POLA2-208	ENST00000534785	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.88	■■■□□ 2.37
POLA2-208	ENST00000534785	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.82	■■■□□ 2.36
POLA2-208	ENST00000534785	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.71	■■■□□ 2.35
POLA2-208	ENST00000534785	WIZ	O95785	1651 aa		29.63	■■■□□ 2.33
POLA2-208	ENST00000534785	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.63	■■■□□ 2.33
POLA2-208	ENST00000534785	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.61	■■■□□ 2.33
POLA2-208	ENST00000534785	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.55	■■■□□ 2.32
POLA2-208	ENST00000534785	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.42	■■■□□ 2.3
POLA2-208	ENST00000534785	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.31	■■■□□ 2.28
POLA2-208	ENST00000534785	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
POLA2-208	ENST00000534785	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.25	■■■□□ 2.27
POLA2-208	ENST00000534785	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
POLA2-208	ENST00000534785	WDR62	O43379	1518 aa		29.19	■■■□□ 2.26
POLA2-208	ENST00000534785	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.18	■■■□□ 2.26
POLA2-208	ENST00000534785	CFTR	P13569	1480 aa		29.07	■■■□□ 2.24
POLA2-208	ENST00000534785	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.94	■■■□□ 2.22
POLA2-208	ENST00000534785	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
POLA2-208	ENST00000534785	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.85	■■■□□ 2.21
POLA2-208	ENST00000534785	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.84	■■■□□ 2.21
POLA2-208	ENST00000534785	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.62	■■■□□ 2.17
POLA2-208	ENST00000534785	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.6	■■■□□ 2.17
POLA2-208	ENST00000534785	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.59	■■■□□ 2.17
POLA2-208	ENST00000534785	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
POLA2-208	ENST00000534785	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.53	■■■□□ 2.16
POLA2-208	ENST00000534785	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.51	■■■□□ 2.15
POLA2-208	ENST00000534785	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
POLA2-208	ENST00000534785	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.31	■■■□□ 2.12	4e-29	■■■■■ 75.3
POLA2-208	ENST00000534785	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
POLA2-208	ENST00000534785	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.31	■■■□□ 2.12
POLA2-208	ENST00000534785	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.31	■■■□□ 2.12
POLA2-208	ENST00000534785	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
POLA2-208	ENST00000534785	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.31	■■■□□ 2.12
POLA2-208	ENST00000534785	FBLN2	P98095	1184 aa		28.3	■■■□□ 2.12
POLA2-208	ENST00000534785	CHD1	O14646	1710 aa		28.29	■■■□□ 2.12
POLA2-208	ENST00000534785	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
POLA2-208	ENST00000534785	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.24	■■■□□ 2.11
POLA2-208	ENST00000534785	SOGA1	O94964	1423 aa		28.19	■■■□□ 2.1
POLA2-208	ENST00000534785	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.19	■■■□□ 2.1
POLA2-208	ENST00000534785	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.19	■■■□□ 2.1
POLA2-208	ENST00000534785	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
POLA2-208	ENST00000534785	CUX1	P39880	1505 aa		28.13	■■■□□ 2.09
POLA2-208	ENST00000534785	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.08	■■■□□ 2.09
POLA2-208	ENST00000534785	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.03	■■■□□ 2.08
POLA2-208	ENST00000534785	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.02	■■■□□ 2.08
POLA2-208	ENST00000534785	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
POLA2-208	ENST00000534785	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.95	■■■□□ 2.07
POLA2-208	ENST00000534785	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.95	■■■□□ 2.07
POLA2-208	ENST00000534785	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
POLA2-208	ENST00000534785	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.92	■■■□□ 2.06
POLA2-208	ENST00000534785	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.89	■■■□□ 2.05
POLA2-208	ENST00000534785	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.87	■■■□□ 2.05
POLA2-208	ENST00000534785	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.85	■■■□□ 2.05
POLA2-208	ENST00000534785	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
POLA2-208	ENST00000534785	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.82	■■■□□ 2.04
POLA2-208	ENST00000534785	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.78	■■■□□ 2.04
POLA2-208	ENST00000534785	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.77	■■■□□ 2.04
POLA2-208	ENST00000534785	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.75	■■■□□ 2.03
POLA2-208	ENST00000534785	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.7	■■■□□ 2.02
POLA2-208	ENST00000534785	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.69	■■■□□ 2.02
POLA2-208	ENST00000534785	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.62	■■■□□ 2.01
POLA2-208	ENST00000534785	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.6	■■■□□ 2.01
POLA2-208	ENST00000534785	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.51	■■□□□ 1.99
POLA2-208	ENST00000534785	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.49	■■□□□ 1.99
POLA2-208	ENST00000534785	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.46	■■□□□ 1.99
POLA2-208	ENST00000534785	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.44	■■□□□ 1.98
POLA2-208	ENST00000534785	NUP160	Q12769	1436 aa		27.41	■■□□□ 1.98
POLA2-208	ENST00000534785	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.31	■■□□□ 1.96
POLA2-208	ENST00000534785	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.26	■■□□□ 1.95
POLA2-208	ENST00000534785	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.23	■■□□□ 1.95
POLA2-208	ENST00000534785	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.19	■■□□□ 1.94
POLA2-208	ENST00000534785	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.17	■■□□□ 1.94

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