Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U3KQA8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U3KQA8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U3KQA8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U3KQA8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
U3KQA8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQA8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQA8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQA8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQA8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQA8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQA8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQA8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQA8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQA8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQA8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U3KQA8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U3KQA8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U3KQA8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U3KQA8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U3KQA8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U3KQA8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQA8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQA8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQA8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQA8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQA8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQA8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQA8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQA8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQA8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQA8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQA8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQA8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQA8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQA8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQA8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQA8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQA8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQA8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U3KQA8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U3KQA8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQA8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQA8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQA8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQA8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQA8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQA8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms