Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHB5Q9Y5E4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB5Q9Y5E4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms