Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXBP1Q9Y5B6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAXBP1Q9Y5B6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms