Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
WDR35Q9P2L0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR35Q9P2L0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR35Q9P2L0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR35Q9P2L0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR35Q9P2L0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR35Q9P2L0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR35Q9P2L0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR35Q9P2L0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WDR35Q9P2L0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms